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| 1 | 2010—2011年湖南省郴州市手足口病EV71型VP1区基因序列分析显示文摘目的了解2010—2011年湖南省郴州市手足口病EV71病毒的基因特征,为手足口病的预防控制提供科学依据。方法从2010—2011年郴州市各县(市、区)送检的手足口病肛拭子标本中随机挑选60份标本采用RD细胞进行病毒分离,采用Real time-RT-PCR方法检测肠道病毒核酸,挑选14株致细胞病变阳性且EV71核酸检测阳性的标本(其中2010年的4株均为郴州市手足口流行夏季高峰期分离株,2011年的毒株主要为冬季高峰期分离株),采用RT-PCR法扩增出EV71分离株的VP1区片段,随后进行VP1区核苷酸序列测定和分析,并使用生物信息学方法作基因特性分析。结果郴州市14株EV71毒株在生物进化树上与C4a亚型的代表株属同一分支。14株EV71毒株之间核苷酸序列的同源性在96.1%~100.0%之间,氨基酸序列的同源性在99.3%~100.0%之间;与A、B、C各基因型和亚型代表株EV71 VP1编码区核苷酸和氨基酸序列同源性分析表明,郴州各分离株与安徽阜阳2008年毒株C4a亚型代表株(EU703812)的同源性最高,其中核苷酸同源性在91.8%~93.3%之间,氨基酸同源性均为99.3%。14株分离株与安徽阜阳2008年毒株(C4a亚型代表株)VP1区段的氨基酸编码序列进行比较,发现K98E、S283T和A293S 3处位点变异,重症病例与普通病例的EV71病毒VP1氨基酸变异无明显差异。结论 2010—2011年郴州市手足口病的优势毒株EV71属于C4a基因亚型。郴州市各县(市、区)的EV71亲缘关系近,毒株基因较稳定,未发现氨基酸突变位点与病例类型有关联。 | 郑文 谭徽 谢群 陈白鹭 陈柏塘 刘爱平 | 2013 | 华南预防医学2013，39，3： | 0 |
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