迷向周期和方法在β-簮结构折褶模拟中的应用(英文)

查看全文 作　　者：[1]吴雄武;Bernard [1]R.Brooks 机构地区：[1]美国国家健康研究院心血肺研究所,bethesdamd20892 出　　处：《南京工业大学学报(自然科学版)》索引2006年第28卷第1期,共7页 摘　　要：采用新近提出的迷向周期和方法(IPS),结合自导Lang evin动态模拟,模拟研究9余肽折褶成β簮结构的情况,表明了该结构与NMR观察到的基本一致,而Ewald模拟由于是强烈的镜像相互作用会产生构型偏差,获得致密构型的几率增大,表明IPS方法更适合于周期边界条件的模拟。 关 键 词：β-簪结构 分子动态模拟 肽折褶 溶剂化 迷向周期和 长程作用