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Molecular Evolution of VEF-Domain-Containing PcG Genes in Plants

查看全文 作　　者：Ling-Jing Chen Zhao-Yan Diao Chelsea Specht Z. Renee [1]Sung 高影响力作者 机构地区：[1]Department of Plant and Microbial Biology, University of California, Berkeley, CA 94720-3102, USA高影响力机构 出　　处：《Molecular Plant》索引2009年第2卷第4期,共17页高影响力期刊 基　　金：ACKNOWLEDGMENTS The authors thank Dr Hong Ma (Pennsylvania State University), the Floral Genome Project, the and the SOL Genomics Network (www.sgn.cornell.edu/) for providing EMF2 homologous eDNA clones, Kazusa DNA Research Institute for providing Lotus japonica EMF2 sequence to Dr Rieko Nishimura, Dr Jo Ann Banks (National Science Foundation/Purdue University) for providing Selaginella EMF2 homologous ESTsequences0 Dr Ralph Quatrano (Washington University) for providing access to the Physcomitrella website, Drs Hong Ma and Damon R. Lisch (UC Berkeley) for comments of the manuscript, Steve Ruzin and Denise Schichnes (Bioimaging Facility, CNR, UC Berkeley) for image processing, and our laboratory members Myriam Calonje, Tiffany Tirtadinata, Robert Luan, Heather Driscoll, and Rosario Sanchez for help and support in preparation of this work. No conflict of interest declared. 摘　　要：Arabidopsis VERNALIZATION2 (VRN2 ) ,胚胎的 FLOWER2 (EMF2 ) ,和授精无关的 SEED2 (FIS2 ) 分别地涉及调停开花结实促进法的 flowering,植物的发展,和种子开发。和 Arabidopsis VEF-L36,他们分享在植物和动物被保存的一个 VEF 领域。调查 VEF-domain-containing 基因(VEF 基因) 的进化,我们越过陆地植物分析了与 VEF 基因有关的序列。迄今为止,从 11 个被子植物家庭的 24 个全身的序列和从另外一个的 54 个部分序列九个家庭被识别。全身的序列的多数识别了分享最大的顺序类似与并且作为 Arabidopsis EMF2 拥有一样的主要领域结构。象 EMF2 一样序列在被子植物之中是普遍的不仅,但是也在裸子植物, lycophyte,和苔藓的 genomic 序列被发现。没有 FIS2-L36-like 或 VEF-L36-like 序列从除 Arabidopsis 以外的植物被恢复,从整个染色体为被定序的米饭和白杨包括。全身的序列的种系发生的分析在密切相关的 taxa 的 EMF2 相当或相同的事物显示出氨基酸顺序保存的高度。当 clade 在更大的 EMF2 clade 以内嵌套, VRN2 相当或相同的事物被恢复。FIS2 和 VEF-L36 在 VRN2 clade 被恢复。VRN2 clade 可能从在 eurosid 的分叉以前发生在 rosids 的一个 EMF2 复制事件演变我和 eurosid II 系。我们建议在染色体进化的动态变化贡献 VEF-domain-containing 基因的家庭的产生。VEF 领域的种系发生的分析独自显示出序列继续根据种类关系发展后面的 EMF2/VRN2 分叉的那 VEF。在动物并且越过陆地植物的象 EMF2 一样序列的存在建议 EMF2 的一种原型形式在植物和动物系的分叉以前是在场的。A 建议了事件的顺序,基于领域组织和在整个被子植物的中间的序列的出现,能从一个象 EMF2 一样祖先的序列向 VRN2 解释进化,祖先的 EMF2 的可能后面的复制。可得到的数据进一步建议 VEF-L36 和 FIS2 从一个象 VRN2 一样祖先的序列被导出。因此,在一个染色体的 VEF-L36 和 FIS2 的存在可能最终依赖于一个象 VRN2 一样序列的存在。 关 键 词：基因植物 分子进化 数域
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