Genomic resources for the brown planthopper, Nilaparvata lugens: Transcriptome pyrosequencing and microarray design

查看全文 作　　者：Chris [1]Bass;Martin Bay [2]Hebsgaard;Joseph [3]Hughes

机构地区：[1]Centre for Sustainable Pest and Disease Management, Rothamsted Research, Harpenden;[2]University of Edinburgh, Institute of Evolutionary Biology, Kings Buildings, Edinburgh;[3]Institute of Biodiversity, Animal Health and Comparative Medicine, College of Medical, Veterinary and Life Sciences, University of Glasgow, Glasgow, United Kingdom

出　　处：《Insect Science》索引2012年第19卷第1期,共12页

摘　　要：棕色的 planthopper, Nilaparvata lugens 是在整个亚洲的栽培米饭的一个害虫并且用杀虫药剂或抵抗米饭变化被控制。这种开发了抵抗到杀虫药剂的许多班,遗传因子型开发了那对先前是剧毒的抵抗米饭栽培变种。昆虫使用 detoxification 酶的一间套房,包括保卫自己对的细胞色素 P450s,谷胱甘肽 S-transferases 和 carboxyl/cholinesterases 种第二等的代谢物和杀虫剂。Roche 454-FLX 站台上的 Pyrosequencing 被用来生产补充存在 Sanger 的数据集定序的一个实质的表示顺序标签(EST ) 在 GenBank 的 EST。一个总数 78 959 读与 37 392 公开地可得到的 Sanger EST 被相结合;这些集合了进 8 911 contigs 和 10 620 单条。分发的分析试验有为生物进程和分子的函数的基因本体论的唯一的基因(拖船) 建议 454 并且 Sanger EST 汇编 N 是广泛地代表性的。lugens transcriptome。planthopper transcriptome 被发现包含编码 P450s,九个编码谷胱甘肽 S-transferases 和这些的 26 编码 carboxyl/cholinesterases 和许多的 31 条拖船的褐通常认为地涉及 xenobiotics 的 detoxification。Agilent eArray 站台被用来构造为 19 000 个 unigene 序列与探针占据的 oligonucleotide microarray,包括知道编码 detoxification 酶的所有那些。在这研究开发的 genomic 资源将对学习这个庄稼害虫的社区有用并且将帮助阐明位于杀虫药剂抵抗和 planthopper 改编下面到抵抗米饭栽培变种的分子的机制。 关键词：焦磷酸测序基因资源褐飞虱基因组芯片设计转录细胞色素P450 抗性水稻品种

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