湖北海棠5A基因进化与表达分析

查看全文 作　　者：罗昌国 [1,2 ][1]乔玉山 [3]张计育索引[1,4]薛华柏索引[1]高志红索引[1]渠慎春 [1]章镇

机构地区：[1]南京农业大学园艺学院,南京210095;[2]贵州省农业科学院果树科学研究所,贵阳550006;[3]江苏省中国科学院植物研究所,南京210014;[4]中国农业科学院郑州果树研究所,郑州450009

出　　处：《西北植物学报》索引2011年第31卷第12期,共9页

基　　金：国家'863'项目(2011AA100204);现代园艺科学优势学科建设工程专项资金;江苏省科技支撑计划(BE2008316) 摘　　要：以水杨酸(SA)诱导的湖北海棠双链cDNA为模板,克隆湖北海棠5A基因并对其序列进行比对分析,用邻位法构建进化树;以根、茎、叶等器官的单链cDNA为模板、以半定量及NCBI数据库相关EST分析研究其5A基因的表达特性,以探讨湖北海棠真核生物蛋白翻译起始因子5A基因序列、表达及进化的相关信息。结果表明:(1)湖北海棠5A基因编码框长度为477个核苷酸,编码159个氨基酸,其序列与部分已报道的双子叶植物一致性达91%,与单子叶植物、细菌、古细菌、藻类一致性分别为96%、55%、70%、63%。(2)蛋白的三级结构显示湖北海棠5A蛋白与拟南芥5A蛋白也十分相似;基因进化分析显示湖北海棠5A基因沿着细菌、古细菌、藻类的进化路径,最后与月季聚在同一分枝中。(3)基因表达分析表明,湖北海棠5A基因不仅在根、茎、叶、花、果实、种子等器官中表达,而且在不同的发育时期和各种胁迫条件下表达,具有组成性表达的特点。 关键词：湖北海棠 5A基因基因进化基因表达

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