肝细胞癌基因表达谱分析

查看全文 作　　者：[1]张宝;[1]唐锴鹰;[1]孙世强;[1]刘坤;[1]冯春琼;[1]吴清华;[2]陈虎;[1]郑文岭;[1]马文丽

机构地区：[1]南方医科大学基因工程研究所,广东广州510515;[2]华南理工大学软件学院,广东广州510641

出　　处：《中华肿瘤防治杂志》索引2012年第19卷第17期,共5页

基　　金：国家自然科学基金(81272483);广东省科技计划资助项目:生物医药高通量数据分析服务平台建设(2010A040302003);非小细胞肺癌靶向药物应用基因检测试剂盒的研制(2011B031800163) 摘　　要：目的:通过分析肝细胞癌(HCC)基因表达谱改变来探讨HCC发病机制。方法:从GEO数据库中下载HCC基因表达数据GSE14215和GSE29217,采用Genespring 11.0软件分析差异表达基因,运用统合分析(meta-analysis)方法确定共同差异表达基因,利用DAVID、KEGG、String和FABLE等生物信息学软件确定相关的生物学过程、分子功能、相互作用通路等。结果:HCC组织与正常肝组织相比,共同下调、上调的差异表达基因分别是281和227个,其中作为转录因子36个;与文献报道的HCC相关基因一致的有181个。差异表达基因主要与细胞周期调控、代谢调节、药物代谢酶系、DNA的损伤复制、p53和过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路(PPAR)等信号通路有关。结论:HCC基因表达谱数据分析表明,细胞周期紊乱主要发生在S、M期;转录因子FOXM1/HNF3高表达与HCC的细胞周期紊乱密切相关。 关键词：癌肝细胞基因表达谱计算生物学细胞周期转录因子

相关文献

参考文献（8）
引证文献（3）
耦合文献（12）

参考文献(8)

引证文献(3)

耦合文献(12)

互联网出版许可证新出网证(渝)字10号全国400电话 - 免长途话费

肝细胞癌基因表达谱分析

参考文献(8)

引证文献(3)

耦合文献(12)

用户提示