Molecular Similarity: Methods and Performance

查看全文 作　　者：Chaoqian [1,2]Cai;Jiayu [1,2]Gong;Xiaofeng [2]Liu;Daqi [1]Gao;Honglin [2]Li

机构地区：[1]School of Information Science and Engineering, East China University of Science and Technology, Shanghai 200237, China;[2]State Key Laboratory of Bioreactor Engineering, Shanghai Key Laboratory of New Drug Design, School of Pharmacy, East China University of Science and Technology, Shanghai 200237, China

出　　处：《Chinese Journal of Chemistry》索引2013年第31卷第9期,共10页

基　　金：the Fundamental Research Funds for the Central Universities,the National Natural Science Foundation of China,the Special Fund for Major State Basic Research Project,the Shanghai Committee of Science and Technology,the 863 Hi-Tech Program of China (No.2012AA020308).Honglin Li is also sponsored by Program for New Century Excellent Talents in University 摘　　要：分子的类似长是一个热话题,它被各种各样的途径和戏在 protein-ligand 和蛋白质蛋白质相互作用识别评估了并且比较一个重要角色。当前有有他们的自己的优点和劣势的分子的类似评估方法的许多类型。分子的指纹是为仅仅关于快速的 2D 使普通基础检索担心,但是缺乏能力关于 3D conformers 编码信息的分子的类似评估的最普通的方法。分子的描述符基于的 3D 方法忍受表示 conformer 的结构信息,而是描述符没被保证精确描述分子的优点。基于的方法试着附加二个分子并且用通常比分子的描述符更精确,但是要求费时间的优化进程的最佳的姿势评估类似的分子的排列。基于的方法仅仅在化学药品上集中的 Pharmacophore 关于一个分子展示并且不能够处理分子的形状类似。为了评估分子的类似的表演,基于屏蔽,许多种度量标准是可得到的,例如,跳跃的视觉表示,量的大小和支架能力大小。分子的类似的进一步的应用包括分子相互作用网络的建设或多样的混合物图书馆的产生。 关键词：分子相似性蛋白质相互作用性能分子相互作用评价方法结构检索三维构象定量测量

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