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径向基函数网络用于细菌的MALDI-TOF-MS分类

查看全文 作  者:[1]张卓勇;[1]王丹;Peter de [2]B.Harrington;Kent [3]J.Voorhees;Jon [3]Rees 高影响力作者 机构地区:[1]东北师范大学化学学院;[2]DepartmentofChemistryandBiochemistry,OhioUniversity,Athens,Ohio45701-2979;[3]DepartmentofChemistryandGeochemistry,ColoradoSchoolofMines,Golden,CO80401高影响力机构 出  处:《计算机与应用化学》索引2002年第19卷第1期,共4页高影响力期刊 基  金:教育部中青年骨干教师基金 摘  要:径向基函数(RBF)网络被用于根据基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对细菌的分类辨识。为了加速网络训练和减少网络的复杂性,本文采用小波变换对原始质谱数据进行压缩,将原来的13828个数据点压缩至328个,且保持了原来的特征谱峰。本文研究了在不同培养时间(24、48和72小时)的5种细菌分类,并对RBF网络参数的影响做了详细地研究,为生物学研究提供了有用的信息。结果表明,约60%以上的细菌样本能够被正确地分类辨识。由于细菌培养的生物学影响因素复杂,因而进一步严格控制细菌的培养条件是改善细菌分类正确率的关键。 关 键 词:径向基函数网络 细菌 分类 基质辅助激光解解吸/电离 飞行时间质谱
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