腊肠树叶绿体基因组序列特征及其系统发育分析

查看全文 作　　者：向如双 [1,2 ][1]段宝忠 [3]孙伟索引宋驰 [4,5 ][6]王艳 Atia tul [7]Wahab [4]孟祥霄

机构地区：[1]大理大学药学院,671000;[2]中国中医科学院中药研究所;[3]中国中医科学院中药生物技术中心;[4]中国中医科学院中药数据中心;[5]成都中医药大学本草基因组学研究院;[6]卡拉奇大学国际化学与生命科学研究院化学研究所;[7]卡拉奇大学分子医学与药物研究所

出　　处：《环球中医药》索引2022年第15卷第12期,共9页

基　　金：国家重点研发计划(2021YFE0100900);中国中医科学院科技创新工程(CI2021A03710)。 摘　　要：目的获取腊肠树(Cassia fistula L.)叶绿体基因组信息特征,对其在决明属(Cassia Linn.)中的系统发育位置进行研究,为腊肠树有效的开发、保护和利用提供理论依据。方法使用Illumina测序技术对腊肠树进行测序,并结合生物信息学方法对其进行叶绿体基因组组装、注释和系统发育分析。结果腊肠树叶绿体基因组长度为161,724 bp,具有典型的四分体结构,总GC含量为36.1%,包含128个基因,其中83个蛋白质编码基因,37个tRNA基因和8个rRNA基因。系统发育分析表明,7个决明属物种被聚为3支,美丽决明S.spectabilis、望江南S.occidentalis、铁刀木S.siamea和决明S.tora聚为一支,腊肠树C.fistula与布鲁斯特决明C.brewsteri聚为一支,山扁豆Chamaecrista mimosoides单独聚为一支,且腊肠树与布鲁斯特决明C.brewsteri的亲缘关系最近。结论从叶绿体基因组系统发育的角度来看,本研究支持2010版的Flora of China的决明亚族植物种类的划分结论,决明属物种中的美丽决明S.spectabilis、望江南S.occidentalis、铁刀木S.siamea和决明S.tora应归为番泻决明属(Senna),腊肠树C.fistula应归为决明属(Cassia),山扁豆Ch.mimosoide应归为山扁豆属(Chamaecrista)。 关键词：腊肠树叶绿体基因组决明属系统发育分子鉴定传统药物

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