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| 1 | 重金属Cd^(2+)、Pb^(2+)和Zn^(2+)对泥鳅DNA损伤的研究显示文摘采用单细胞凝胶电泳技术(SCGE),研究重金属Cd2+、Pb2+、Zn2+在不同暴露时间(1—35d)、单一重金属离子不同暴露浓度(0.05mg/L、0.5mg/L、5.0mg/L)或混合重金属离子(Cd2++Pb2+、Cd2++Zn2+、Pb2++Zn2+、Cd2++Pb2++Zn2+)相同浓度(0.5mg/L)条件下对泥鳅肝胰脏细胞核DNA的损伤作用。以带彗尾核DNA百分率和彗尾长度(TL)与核直径(D)比值为指标,探讨DNA损伤级别与处理浓度间的相关性。结果显示,随着处理时间的延长,带彗尾核DNA百分率和TL/D值均呈上升趋势,5.0mg/L Zn2+组28d时带彗尾核DNA百分率最高(84.85%),35d的TL/D值亦为所有组中最高(2.50);对DNA损伤作用,初期以1级损伤为主,7d后以3级损伤为主,且损伤率超过80%;Cd2+、Pb2+和Zn2+之间的联合毒性表现复杂,但总体表现为Cd2+存在时能增强Pb2+或Zn2+对DNA的损伤作用。总之,重金属Cd2+、Pb2+和Zn2+对泥鳅肝胰脏细胞核DNA损伤具有明显的浓度和时间效应,利用SCGE技术可对水环境污染导致的生物基因毒性作用进行监测。 | 张迎梅 王叶菁 虞闰六 张晟 吴振斌 | 2006 | 水生生物学报2006，30，4： | 44 |
| 2 | 重金属胁迫对泥鳅肝胰脏ATPase和SOD活性的影响显示文摘以泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)为研究对象,研究不同重金属离子(Cd、Pb、Zn)在不同暴露时间(1、2、4、7、14、21、28、35 d)、不同暴露浓度(0.05、0.5、5.0 mg/L)下对泥鳅肝胰脏ATPase和SOD活性的影响.结果显示,处理组中ATPase和SOD活性分别为0.300~1.820和0.206~2.477;活性变化表现为先下降后上升再下降;低浓度处理组(Cd0.05和Zn0.5对ATPase;Cd0.05组对SOD活性在1 d时)对它们的活性有极显著诱导作用(P〈0.01),高浓度处理组(Cd5.0、Pb0.5和Pb5.0组对ATPase;Pb5.0、Zn0.5和Zn5.0对SOD活性在1 d时)则表现为显著抑制作用(P〈0.05);混合重金属离子间相互作用十分复杂,既有协同作用也有拮抗作用,但均表现为毒性增强作用,对ATPase和SOD活性的诱导作用减弱,抑制作用增强. | 张迎梅 王叶菁 虞闰六 周敏 | 2008 | 甘肃科学学报2008，20，3： | 33 |
| 3 | 宁夏沙坡头荒漠生态环境鸟类季节性消长研究显示文摘20 0 0年 1 0月至 2 0 0 1年 9月逐月对宁夏沙坡头地区荒漠景观鸟类进行了统计。调查区包括三种景观 :荒漠半荒漠 ,居民点和人工固沙林。对 65种鸟类的食性、居留型以及在各景观中的季节性变化作了分析。虽然各景观中分布的鸟类物种数差异不大 :荒漠半荒漠景观 42种 ,居民点景观 41种 ,人工林景观 43种 ,但各景观中的鸟类种类、密度和季节性变化差异显著 。 | 张迎梅 包新康 虞闰六 李新荣 | 2002 | 中国沙漠2002，22，6： | 10 |
| 4 | 高通量检测全基因组DNA甲基化方法的建立显示文摘目的:建立焦磷酸测序技术联合甲基化敏感性内切酶高通量定量分析全基因组DNA甲基化水平的方法(PME)。方法:以Lambda DNA为标准品,取>10倍浓度梯度DNA(125、250、500、1 000和2 000ng)进行双酶切后焦磷酸测序,检测甲基化程度,分析测序峰值与模板量相关性;以经甲基化酶(M.SssⅠ)处理的Lambda DNA为阳性对照品,与阴性对照品(未经甲基化酶处理的阴性Lamb-da DNA)混合(混合比例分别为0、25%、50%、75%和100%),进行甲基化程度相关性分析;以该实验方法对8例健康体检者和6例非小细胞肺癌(NSCLC)组织DNA进行分析。结果:测序峰值与模板量呈线性相关,在125~2 000ng,实验重复性良好;阳性对照品甲基化程度为100%,阴性对照品为0,甲基化水平呈线性相关,相关系数为0.999。健康人甲基化水平平均值为0.446 64,NSCLC患者为0.489 150,差异明显。结论:成功构建了焦磷酸测序技术联合甲基化敏感性内切酶分析全基因组DNA甲基化水平的方法。该方法适合于样本的高通量分析,为临床检测全基因组DNA甲基化状态、肿瘤早期诊断提供了新思路。 | 张锋 虞闰六 任绪义 | 2011 | 中华肿瘤防治杂志2011，18，21： | 5 |
| 5 | 宁夏沙坡头地区环境结构变化与鸟类生物多样性显示文摘20 0 0年 10月~ 2 0 0 1年 9月 ,对宁夏沙坡头沙漠地区景观类型、植被盖度、鸟类种类和多样性逐月进行了调查 .与 1987年沙坡头地区夏季鸟类种类与数量调查结果相比较 :荒漠半荒漠景观中鸟类种数不变 ,密度 (只· km-1)由 4 3.4 5减至 2 2 .73,多样性指数 (H)由 2 .4 639降至 1.95 00 ,均匀度指数 (D)由 0 .90 60降至 0 .7641;人工林中鸟类种数从 1987年的 8种提高到 15种 ,密度由 2 1.64降至 14.32 ,H由 1.7113升至 2 .1760 ,D从 0 .7697提高到 0 .84 32 ;居民点景观中鸟类种数由 16种增加到 2 1种 ,密度由 5 2 .72增加到 112 .2 4 ,H由 2 .0 4 36提高到 2 .60 10 ,D由0 .7798升至 0 .915 0 .结合 1987年以来沙坡头地区环境的变化 ,讨论了环境改变与鸟类多样性的关系以及鸟类在促进沙漠生态系统良性循环中的作用 . | 虞闰六 包新康 张迎梅 李新荣 | 2002 | 兰州大学学报(自然科学版)2002，38，6： | 5 |
| 6 | 新生儿耳聋基因检测结果分析显示文摘目的评估耳聋基因筛查在新生儿听力缺损中的临床应用价值。方法对杭州迪安医学检验中心提供的2018年8月至2019年9月出生的4020个新生儿采集足跟血,提取基因组DNA进行4个耳聋易感基因21个位点[GJB2基因(c.35 del G、c.176191 del 16、c.235 del C、c.299300 del AT、c.109 G>A、c.167delT)、GJB3基因(c.538 C>T、c.547 G>A)、SLC26A4基因(c.919-2 A>G、c.1174 A>T、c.1226 G>A、c.1229 C>T、c.1707+5 G>A、c.1975 G>C、c.2027 T>A、c.2168 A>G、c.2162 C>T、c.281 C>T、c.589 G>A)和线粒体12S r RNA(m.1494 C>T、m.1555 A>G)]的检测;同时比较国内2019年发表的数据。结果4020名新生儿中,检出耳聋基因异常的阳性率为3.29%,其中GJB2基因变异的检出率为2.91%,GJB3基因检出率为0.16%,SLC26A4基因检出率为0.12%,线粒体12S r RNA突变检出率为0.1%。结论耳聋易感基因筛查能够从分子水平发现新生儿非综合型耳聋,为早期发现新生儿耳聋和早期干预提供参考。 | 杨慧波 虞闰六 缪勤 刘德良 | 2020 | 昆明医科大学学报2020，41，7： | 4 |
| 7 | 单管PCR-Pyrosequencing快速检测华法林代谢酶基因多态性方法的建立显示文摘文章旨在建立一种单管、快速及高通量的华法林药物代谢酶相关基因多态性的检测方法。通过抽取人外周血DNA,应用带有生物素标记的扩增引物,经PCR扩增并制备焦磷酸测序单链模板,于PyroMark ID焦磷酸测序仪上进行焦磷酸测序,以Sanger测序法测序结果为对照,观察分析的准确性。结果显示,华法林药物代谢酶的3个相关基因多态性(CYP2C9*2、CYP2C9*3、VKORC1(-1693))于单管中可被同时检测,一次可获得96份DNA的华法林药物代谢相关多态性位点检测结果。经与Sanger测序方法比较,符合率为100%。结果表明本方法可准确、高通量、快速检测华法林药物代谢酶相关基因多态性,与单管检测一个位点的焦磷酸测序方法相比,能有效降低检测成本,节省检测时间。该方法在个性化医疗上有较大的推广应用价值,也可以将该平台运用于其他疾病相关基因多态性检测。 | 施宏 虞闰六 马金飞 任绪义 | 2011 | 遗传2011，33，11： | 3 |
| 8 | PCR—Pyrosequencing快速检测药物代谢酶基因CYP2C19多态性方法的建立及应用显示文摘目的旨在建立一种快速及高通量的CYP2C19药物代谢酶相关基因多态性的检测方法,为个体化治疗提供用药参考。方法抽取96例人外周血DNA,应用带有生物素标记的扩增引物,经PCR扩增并制备焦磷酸测序单链模板,于PyroMarkID焦磷酸测序仪上进行焦磷酸测序,且以Sanger测序法测序结果为对照,观察分析准确性。结果运用焦磷酸测序可以成功检测CYP2C19相关基因型;单个sNP住点检测经与Sanger测序方法比较,符合率为100%。同时,通过设计焦磷酸测序引物,两个PCR产物可合并于一管中进行焦磷酸测序,与单管检测一个位点的焦磷酸测序方法相比,能有效降低检测成本,节省检测时间。结论该方法可准确、高通量、快速检测药物代谢酶相关基因多态性,该方法在个性化医疗上有较大的推广应用价值,也可以将该平台运用于其他疾病相关基因多态性检测。 | 施宏 虞闰六 马金飞 任绪义 | 2012 | 现代检验医学杂志2012，27，1： | 3 |
| 9 | 乙肝病毒常见耐药位点突变高通量检测方法的建立与应用[J]显示文摘 | 虞闰六 任绪义 王敏 | | 实用检验医师杂志0，，： | 2 |
| 10 | 焦磷酸测序技术快速鉴定体液病原菌方法的建立与应用显示文摘目的 建立一套快速准确鉴定临床体液样本病原菌的方法学体系,评价其作为病原菌检测方法在临床检验中的应用价值.方法 采用柱式抽提试剂盒抽提205份体液样本中病原菌基因组dna,以细菌16s rrna基因为目标序列,通用引物扩增高变区片段,以焦磷酸测序技术进行扩增子序列分析并与数据库中的序列进行比对和病原菌种属鉴定.同时采用传统的细菌培养-生化方法进行病原菌检测鉴定,并以此为金标准,采用spss 11.0软件计算焦磷酸测序法检测敏感度、特异度、假阳性率、假阴性率、阳性预测值、阴性预测值、阳性似然比及阴性似然比,评价新方法的可行性与实用性.结果 细菌培养阳性率为39.5%( 81/205),其中71例为单一病原菌感染,10例为双重混合感染;与培养-生化鉴定结果相比,焦磷酸测序检测鉴定单一病原菌感染样本结果符合率为100%(71/71),鉴定双重混合感染样本10例中有7例符合.此外,对培养阴性的124例体液样本用焦磷酸测序检测鉴定,结果10例为阳性,且均为单一细菌感染.以培养方法作为金标准,焦磷酸测序法鉴定体液病原菌敏感度达100%,特异度为91.9%,假阳性率为8.1%,假阴性率为0%,阳性预测值为89.0%,阴性预测值为100%,阳性似然比为12.4,阴性似然比为0.结论 焦磷酸测序法直接检测鉴定临床体液样本中的病原菌具有快速、高敏感性、高准确率等优势,在临床病原微生物检测中具有很强的实用性和广阔的应用前景.
abstract:
objective to develop a method for rapid and accurate detection and identification of bacterial pathogens directly from body fluid specimens and to evaluate its application in clinical laboratory.methods bacteria dna was extracted from 205 body fluid specimens with column-based kit,and the high variable v1 and v3 regions of bacterial 16s rrna gene were amplified with broad-range primers.amplicons were analyzed by pyrosequencing and the generated sequences were searched in the bacterial identification database.traditional culture-biochemical method was also used for these specimens and the results were taken as the golden standard.spss 11.0 was used to calculate the sensitivity,specificity,false positive/negative rate,positive/negative predictive value and positive/negative likelihood rate of pyrosequencing method.results the positive rate of bacteria culture was 39.5% (81/205),among which 71 were infected with single bacterium,and 10 were infected with two species of bacteria.compared with the culture identification results,pyrosequencing had a 100.0% (71/71) concordance when applied to detect and identify bacterial pathogens from specimens with single specie bacterium infected.to specimens with two species bacteria infected,7 out of 10 specimens were in concordance with the culture identification results.besides,pyrosequencing detected 10 positive specimens and identified bacterial pathogens infected in the 124 culture-negative specimens.taken bacteria culture as the standard method,the sensitivity of pyrosequencing for identifying bacterial pathogen in body fluid was 100.0%,and with a specificity of 91.9%,the false positive rate was 8.1%,the false negative rate was 0.0%,the positive predictive value was 89.0%,the negative predictive value was 100.0%,and the positive and the negative likelihood rate were 12.4 and 0,respectively.conclusion pyrosequencing can be used to detect and identify bacterial pathogens directly from body fluid specimens with the advantages of rapidity,high sensitivity,high accuracy and high throughput. | 任绪义 林洁 虞闰六 章静 吕江峰 | 2011 | 中华临床感染病杂志2011，4，6： | 1 |
| 11 | PCR-焦磷酸测序法快速鉴定菌血症病原菌显示文摘世界范同内成人和儿童菌血症都是高发病率和高死亡率的疾病,每年世界范围内菌血症患者有2000万例。因病原菌不能鉴定而应用广谱抗生素或不适当抗生素治疗所导致的死亡率非常高,但欧洲每年仍有135000例患者死于菌血症,在美国更是高达215000例。 | 吕江峰 虞闰六 王敏 章静 任绪义 | 2011 | 中华检验医学杂志2011，34，8： | 0 |
| 12 | 特发性男性不育患者精浆蛋白质分析显示文摘目的寻找诊断特发性男性不育的生物标记分子。方法应用二维电泳与质谱技术(MS+MS/MS)分析特发性男性不育患者与正常对照组精浆蛋白质组成,寻找差异表达蛋白质。结果特发性男性不育患者较正常对照组精浆中血清白蛋白和前列腺酸性磷酸酶减少,而组织蛋白酶B和锌α2糖蛋白增加。结论特发性男性不育可能与精子获能受阻及精液免疫功能紊乱有关。 | 任绪义 周敏兰 张欣宗 刘洋 虞闰六 | 2009 | 基础医学与临床2009，29，7： | 3 |
| 13 | 快速鉴定幽门螺杆菌与宿主基因型的方法学研究显示文摘目的探索采用焦磷酸测序技术进行幽门螺杆菌(Hp)鉴定与耐药以及宿主胃癌易感相关基因多态性分析的可行性,为临床提供一种快速的分析手段和诊疗依据。方法提取60例胃黏膜活检标本DNA(Hp阳性、阴性各30例),PCR扩增Hp 16S rDNA,23S rDNA以及人白细胞介素1B(IL-1B)基因特异性片段,对3个片段同时进行焦磷酸测序分析。结果 30例Hp阳性标本16S rDNA测序结果一致,均为5-′CGCGCAATCAGCGT-CAGTAATG-3′,该序列可作为标志性序列来鉴定Hp;对Hp阳性标本23S rDNA 2142及2143位点的多态性分析发现2142A→G突变,该突变通常会导致Hp对克拉霉素的耐药;对60例标本IL-1B基因-31和-511位点的多态性检测表明,-31位点有两种基因型,其中A/G基因型占80.0%,G/G 20.0%;-511位点有3种基因型,其中T/C基因型占60.0%,T/T基因型占26.7%,C/C基因型占13.3%。结论运用焦磷酸测序技术进行Hp鉴定、耐药性分析以及宿主胃癌易感性分析,具有准确、快速、操作方便、通量高等优势;除了胃黏膜活检标本,该方法亦可应用于其他标本如粪便、唾液、胃液等的Hp检测,同时可推广至其他菌种的鉴定和耐药分析,在弥补甚至替代传统的病原菌检测方面具有广阔的应用前景。 | 吕江峰 虞闰六 王栋梁 王敏 杨文波 任绪义 | 2011 | 中华医院感染学杂志2011，21，15： | 2 |
| 14 | 骨质疏松症患者重组人甲状旁腺素(1-34)治疗前后血清蛋白质分析显示文摘目的:寻找监测重组人甲状旁腺素(1-34)治疗骨质疏松症预后的蛋白质标志物。方法:应用双向电泳与质谱技术(MS+MS/MS)分析骨质疏松症患者重组人甲状旁腺素(1-34)治疗前后血清蛋白质表达谱变化,寻找差异表达蛋白质。结果:骨质疏松症患者通过重组人甲状旁腺素(1-34)治疗后较治疗前,性激素结合球蛋白水平下降,而锌指蛋白则表达上升。结论:初步认为性激素结合球蛋白和锌指蛋白在重组人甲状旁腺素(1-34)治疗骨质疏松症过程中发挥着重要调控作用。 | 周欢琴 朱杰 翁秀妹 吴国友 虞闰六 谢海宝 万晓晨 | 2010 | 中国卫生检验杂志2010，20，12： | 2 |
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