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| 1 | 肝细胞癌基因表达谱分析显示文摘目的:通过分析肝细胞癌(HCC)基因表达谱改变来探讨HCC发病机制。方法:从GEO数据库中下载HCC基因表达数据GSE14215和GSE29217,采用Genespring 11.0软件分析差异表达基因,运用统合分析(meta-analysis)方法确定共同差异表达基因,利用DAVID、KEGG、String和FABLE等生物信息学软件确定相关的生物学过程、分子功能、相互作用通路等。结果:HCC组织与正常肝组织相比,共同下调、上调的差异表达基因分别是281和227个,其中作为转录因子36个;与文献报道的HCC相关基因一致的有181个。差异表达基因主要与细胞周期调控、代谢调节、药物代谢酶系、DNA的损伤复制、p53和过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路(PPAR)等信号通路有关。结论:HCC基因表达谱数据分析表明,细胞周期紊乱主要发生在S、M期;转录因子FOXM1/HNF3高表达与HCC的细胞周期紊乱密切相关。 | 张宝 唐锴鹰 孙世强 刘坤 冯春琼 吴清华 陈虎 郑文岭 马文丽 | 2012 | 中华肿瘤防治杂志2012,19,17: | 3 |
| 2 | DNA甲基化分析方法及相关应用显示文摘DNA甲基化与基因调控关系密切,且对生物体生长发育等正常生理过程和肿瘤、心血管等多种疾病的病理过程有重要影响。近年来随着对表观遗传学及DNA甲基化的深入研究,基因组中甲基化位点的发现、检测及甲基化'图谱'的认识发展迅速。本文拟就DNA甲基化分析方法和相关应用进行初步总结和探讨,以期指导各方法的进一步完善,为表观遗传、基因印迹、肿瘤等疾病的研究提供强有力的技术支持。 | 李金慧 张波 朱伟 | 2014 | 癌变.畸变.突变2014,26,4: | 2 |
| 3 | 焦磷酸测序定量检测γ珠蛋白基因启动子区甲基化显示文摘目的:采用焦磷酸测序定量检测人体γ珠蛋白基因(HBG)启动子区甲基化。方法:收集30例经基因检测确诊为轻型β-地中海贫血(简称地贫)患者的全血DNA样本,查找γ珠蛋白基因的启动子区Cp G位点,设计PCR扩增引物及焦磷酸测序引物;DNA样本经亚硫酸氢盐转化后进行PCR扩增,对PCR产物作单链处理,在测序引物的引导下进行焦磷酸测序,对Cp G位点的甲基化程度进行定量分析。结果:30例轻型β-地贫患者的HBG启动子区共150个Cp G位点均得到了甲基化程度的定量结果,其中-53、-50、+5、+16及+49位点高甲基化分别有28例、24例、13例、0例及7例,中甲基化分别有2例、6例、17例、30例及23例,未检测到低甲基化。结论:焦磷酸测序可对HBG启动子Cp G位点的甲基化程度进行定量检测。 | 杨楠楠 李贵芳 徐琴 罗振元 李頔 熊永红 王仕敏 黄盛文 | 2018 | 贵州医科大学学报2018,43,3: | 1 |
| 4 | DNA甲基化的焦磷酸测序通过率显示文摘目的研究不同的PCR产物投入量(2.5μL,5μL和10μL),对焦磷酸测序通过率的影响.方法从20例酒依赖患者和20例健康对照全血样本中提取DNA.按各样本的DNA用量200 ng进行亚硫酸盐转化,经PCR扩增后,按PCR产物不同投入量(2.5μL,5.0μL和10.0μL),对目的基因序列进行焦磷酸测序.结果比较各组平均峰高值和焦磷酸测序通过率,5μL体系的平均峰高以及焦磷酸测序通过率均高于2.5μL体系;10.0μL体系高于5μL体系,10μL体系为最佳.3组平均峰高和焦磷酸测序通过率,差异有统计学意义(P<0.05).结论在DNA量统一为200 ng进行亚硫酸盐转化的前提下,所得PCR产物投入量以10μL为最佳,焦磷酸测序通过率最高,达100%. | 赵斐 姜焰凌 张寿勋 夏生 鲍建军 张柠 杨晓佩 钟树荣 | 2017 | 昆明医科大学学报2017,38,10: | 0 |
| 5 | 人GADD45α荧光素酶报告基因质粒的构建与鉴定显示文摘目的为检测环境中可能存在的致癌物,建立生长阻滞和DNA损伤诱生蛋白45(GADD45α)双荧光素报告基因系统,构建新型人GADD45α荧光素酶报告基因质粒。方法在GADD45α基因启动子序列2.2 kb及其后基因组DNA序列2.6 kb范围内,设计3对引物进行搭桥PCR,获得全长为4924 bp的目的序列,插入pGL4.10[luc2]质粒相应位点内。质粒构建成功后测定全长并进行酶切鉴定。结果正确扩增了全长为4.9 kb的人GADD45α基因片段,成功构建了人GADD45α报告基因质粒(pGD2.2K-luc2)。结论在质粒设计中加入了存在p53非依赖性BRCA1结合位点的GADD45α基因第1个内含子,构建成功的pGD2.2K-luc2,为转染人源性细胞建立GADD45α双荧光素报告基因系统打下了基础。 | 殷宏 王恺 田世民 安子扬 邹明强 | 2014 | 解放军医药杂志2014,26,7: | 0 |