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| 1 | SNP分子标记的研究及其应用进展显示文摘SNP标记作为第三代分子标记,在分子遗传学、药物遗传学、法医学以及疾病的诊断和治疗等方面发挥着重要作用。介绍了SNP标记的定义与特点,对近年来以SNP标记为基础构建的Bin图谱、高通量SNP芯片分型以及以SNP标记为基础进行群体进化研究等三方面的应用概况进行了简述。提出了SNP标记现阶段发展存在的问题,并对其发展前景予以展望。 | 唐立群 肖层林 王伟平 | 2012 | 中国农学通报2012，28，12： | 136 |
| 2 | 小麦株高相关性状与SNP标记全基因组关联分析显示文摘株高是影响小麦产量和控制倒伏的重要因素,研究小麦株高相关性状的遗传机制对高产育种具有指导意义。以205份中国冬麦区小麦品种(系)为材料,利用分布于小麦全基因组的24 355个单核苷酸多态性(SNP)标记对株高相关性状进行关联分析。共发现38个与株高相关性状显著关联(P<0.0001)的SNP,分布在1B、2A、2B、3A、3B、3D、4A、4B、5A和6D染色体上。其中,11个位点至少在2个环境中稳定表达,可用于开发CAPS标记。同时,发掘了一批株高性状相关基因的优异等位变异,如降低株高的等位变异Bob White_c48009_52,平均降低株高12.9 cm;控制穗下节间长的等位变异BS00039422_51-C和IAAV1698-A,分别调控穗下节间长5.9 cm和6.6 cm。本研究发掘的控制小麦株高基因位点为在分子水平上研究小麦株高复杂性状提供了有价值的参考。 | 陈广凤 陈建省 田纪春 | 2015 | 作物学报2015，41，10： | 42 |
| 3 | 分子标记技术及其在水稻基因定位上的应用显示文摘分子标记作为一种新兴的遗传标记手段,因其特有的优势而得到广泛的应用,带动了许多领域的快速发展。本文主要对分子标记的一般特点,基于全基因序列、简单重复序列、已知的特定序列、反转录转座子、单核苷酸的分子标记的类型及各类型代表性技术的基本原理和各自的优缺点进行详尽的综述,并进一步介绍了近年来分子标记在水稻基因定位上的相关应用,如水稻高产、优质、抗逆和抗病等重要农艺性状基因的分离克隆。最后还对分子标记技术在遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种等方面的应用前景予以展望,以期该技术能发挥更大的作用。 | 孙正文 黄兴奇 李维蛟 钟巧芳 余腾琼 郭怡卿 李定琴 殷富有 程在全 | 2011 | 基因组学与应用生物学2011，30，1： | 28 |
| 4 | 基于SNP位点鉴定砂仁药材物种显示文摘目的:为建立基于单核苷酸多态性(SNP)技术鉴别砂仁3个基原(阳春砂Amomum villosum、海南砂Amomum longiligulare、绿壳砂Amomum villosum var.xanthioides)的方法,对这3个种共计60份材料ITS2序列进行分析比较。方法:将实验所得砂仁ITS2序列,应用CodonCode Aligner软件进行序列拼接比对。用MEGA 5.0导出各序列变异位点,并对变异位点进行分析。为验证结果准确性,下载砂仁3个基原GenBank的所有ITS2序列,共计34条,对结果进行验证。结果:砂仁ITS2序列比对后长度为230 bp,3个不同基原在135 bp和199 bp处存在稳定SNP(s)变异位点。结论:本研究开发的两个稳定的SNP(s)位点可以快速准确地鉴定砂仁药材3个基原。 | 焦文静 张鹏 廖保生 王丽丽 韩建萍 | 2014 | 世界科学技术-中医药现代化2014，16，2： | 14 |
| 5 | 分子标记技术在甜菜育种中的应用显示文摘分子标记技术与常规育种技术相互紧密结合能显著提高育种效率。为了更好地阐明分子标记在甜菜育种中的作用,总结了国内外分子标记在甜菜亲缘关系及遗传多样性研究、遗传连锁图谱构建、数量性状基因定位(QTL)、分子标记辅助选择育种、杂种优势及种质鉴定中的研究现状和存在的问题。指出建立相应的高效分子标记辅助选育体系,创造出高产、优质、多抗或具广谱抗性的甜菜种质或品种是甜菜分子育种的研究方向。当前甜菜种质资源鉴定的关键任务是大力开发新型的分子标记进行甜菜种质资源遗传分析,绘制指纹图谱,进一步构建甜菜种质分子身份证。今后应加强对甜菜重要农艺性状基因进行精细定位,充分发掘QTL的信息,构建更为饱和的分子标记连锁图谱。 | 倪洪涛 倪洪波 张福顺 | 2016 | 中国农学通报2016，32，16： | 12 |
| 6 | 转录组学在牧草上的应用进展显示文摘牧草是发展草地畜牧业的重要基础。随着高通量测序技术的发展,转录组测序在牧草种质资源评价、重要性状形成机制以及优异基因资源挖掘、分子标记开发等方面已有较广泛的应用。本文从生长发育、生物胁迫适应机制、非生物(盐碱、极端温度、干旱、营养亏缺、重金属等)胁迫适应机理、逆境转录因子挖掘和分子标记筛选等方面对当前有关牧草转录组学研究进展进行综述并展望,以期为相关研究工作的开展提供参考。 | 王飞 刘林波 高天歌 高鲤 包爱科 王锁民 | 2019 | 草业科学2019，36，2： | 9 |
| 7 | 棉花细胞质雄性不育育性恢复基因的定位及分子标记辅助育种研究进展显示文摘棉花细胞质雄性不育系统在实现棉花杂交种子大规模生产和培育高产、优质、抗逆等棉花新品种中具有重要的应用价值,而恢复系的好坏对细胞质雄性不育系杂交种的选育的利用起着举足轻重的作用。因此,培育优良恢复系至关重要。主要介绍了棉花细胞质雄性不育系、恢复系的类型,综述了棉花细胞质雄性不育育性恢复基因的遗传方式和遗传定位研究进展,讨论了恢复基因的精细定位和分子标记鉴定在分子标记辅助育种中的意义和应用前景,并针对目前存在的问题提出相应对策。 | 曹秀霞 吴建勇 邢朝柱 郭立平 戚廷香 王海林 | 2012 | 中国农学通报2012，28，6： | 9 |
| 8 | DNA分子标记及其在水稻遗传育种研究中的应用显示文摘简要综述了DNA分子标记的概念、特点、种类,分子标记在水稻遗传连锁图谱的构建、基因定位、种质资源研究、分子标记辅助选择育种、水稻品质性状的分子标记等研究中的应用,并对DNA分子标记技术在水稻遗传育种研究中的应用前景进行了展望。 | 秦延春 | 2012 | 广东农业科学2012，39，7： | 8 |
| 9 | 单核苷酸多态性(SNP)分型的主要方法及研究进展显示文摘近年来,随着现代分子生物学的发展,遗传标记也在不断的发展与进步。目前,基因的单核苷酸多态性(SNP)已成为继RFLP,SSR之后的第三代分子遗传标记。SNP是指在基因组水平上单个核苷酸变异引起的DNA序列多态性,包括单碱基转换、颠换、插入及缺失等形式,具有数量丰富,分辨率高,覆盖基因组范围大,遗传稳定等主要优点。因此,SNP可广泛应用于农学、医学及生物进化等相关领域,作为稳定的分子遗传标记从而开展相关研究。 | 刘健 宋倩倩 翁巧琴 张金枝 | 2016 | 浙江畜牧兽医2016，41，3： | 4 |
| 10 | 九里香药材及其近缘物种ITS2分子鉴定研究显示文摘目的:应用中药材DNA条形码鉴定体系核心序列ITS2对九里香药材及其混伪品进行鉴定研究。方法:按照中药材DNA条形码分子鉴定法标准流程获取九里香药材及其混伪品ITS2序列,进行种内和种间变异分析,采用最近距离法、SNPs位点分析以及建树法,综合评估该序列的鉴定能力。结果:九里香药材及其近缘物种ITS2序列长度220~234 bp,基于K2P遗传距离不能有效区分九里香、千里香和翼叶九里香,序列分析发现九里香Murraya exotica与其他物种有3个稳定的单核苷酸多态性(SNP)位点,在UPGMA树中,不同物种的样品聚在一起,表明ITS2序列可以区分九里香药材及其近缘物种。利用中药材DNA条形码鉴定系统对44份千里香待检样品进行BLAST鉴定,结果均为正品千里香。结论:ITS2序列可用于九里香及其同属近缘物种的鉴定,为九里香药材的市场监控提供了有效手段,为其本草基因组学研究提供了依据。 | 邢建永 周红 吴正军 韩正洲 王瑀 姚辉 | 2020 | 世界中医药2020，15，11： | 4 |
| 11 | 葫芦科作物重要性状基因定位研究进展显示文摘瓜类是重要的蔬菜、水果类作物,随着生活水平的不断提高,人们更加注重农产品的品质和产量,因此进一步提高瓜类产品的品质和产量,满足人们对优质农产品的需求成为当前科学研究的重要任务之一。优良品种选育是进一步提高葫芦科蔬菜作物品质和产量的有效方法,分子育种是加速育种进程的重要手段,而基因定位是现代分子育种研究的基础。本文综述了主要葫芦科作物重要性状基因定位的策略、方法以及初步定位和精细定位工作的研究进展,为相关作物的基因精细定位、基因克隆研究提供参考依据,并对今后的葫芦科作物精细定位技术提出了展望。 | 周萌萌 王佳楠 田丽波 商桑 潘琼玉 邹凯茜 曾丽萍 | 2018 | 热带作物学报2018，39，3： | 3 |
| 12 | 基于SLAF-seq技术的向日葵SNP标记开发与利用显示文摘为解决向日葵基因组序列庞大及基因位点挖掘的问题,试验共收集了122份向日葵资源材料,利用SLAF-seq技术,以菊科小蓬草基因组作为参考基因组进行酶切预测,水稻日本晴测序数据为对照进行比对,获得多态性标签,并开发大量特异性SNP。本研究共获得477.76 M Reads数据,读长范围在1 329 754~5 770 666之间,对照数据的双端比对效率为92.96%,酶切效率为95.07%,平均Q30为92.32%,平均GC含量为43.04%,每个样本平均开发171 684个SLAF标签,样本SLAF标签的平均测序深度为20.07 x,通过生物信息学分析,共获得1 105 347个SLAF标签,其中多态性SLAF标签共有86 985个,共鉴定到414 692个群体SNP。这些SNP位点可为向日葵特异SNP标记的开发、资源鉴定分析以及农艺性状的关联分析等提供理论依据。 | 马宇 于海峰 侯建华 石煜 温蕊 李振 | 2018 | 分子植物育种2018，16，18： | 3 |
| 13 | 分子标记在高粱抗病虫基因定位上的研究进展显示文摘高粱属禾本科是世界第五大粮食作物。具有耐干旱和耐高温等特性。一些病虫害的存在和发生严重影响了高粱的质量和产量。随着分子标记的迅速发展,逐渐地被应用到高粱的抗病虫基因研究中。现主要介绍了几种高粱常见的病虫害,并且评述了近年来分子标记在抗丝黑穗病和抗蚜虫基因定位方面的研究进展。 | 邢慧清 黄赛楠 张云鹤 李玥莹 | 2012 | 黑龙江农业科学2012，，9： | 2 |
| 14 | 馒头色泽与质构性状的GWAS分析显示文摘为从分子水平研究控制馒头色泽与质构性状的基因位点,以205份不同小麦品种为实验材料,利用分布于小麦全基因组的24 355个单核苷酸多态性(SNP)标记对馒头色泽与质构性状进行关联分析。结果检测到276个馒头色泽性状显著关联位点,其中23个极显著(P <0. 000 1)关联位点,30个高遗传贡献率位点(R^2>10%),9个位点在2个以上环境中检测到,分布于小麦21条染色体中的13条。检测到23个与馒头质构性状存在显著关联的多效性位点,分布于小麦的15条染色体,本研究所得到的这些标记为结合分子育种技术改良馒头用小麦品种提供了有价值的参考。 | 吴澎 刘娟 陈广凤 赵子彤 杨艺 李向阳 唐晓珍 田纪春 | 2018 | 中国粮油学报2018，33，11： | 1 |
| 15 | 烟草开花期全基因组关联分析显示文摘烟草开花期影响烟叶的产量和品质,是决定生态适应性和产量的重要性状,与各种生物或非生物胁迫密切相关。研究烟草开花期的遗传规律,进而解析调控开花时间的分子基础,对烟草品种改良具有重要意义。本研究选用烟草MAGIC(Multiparent Advanced Generation Inter-crossing)群体为材料,利用高密度烟草SNP(Single Nucleotide Polymorphism)芯片进行基因型分析,进而对开花期性状进行全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study,GWAS)。结果表明,共检测到13个与烟草开花期性状显著关联位点,其中位于12号染色体109616410 bp位置上的SNP为最显著关联位点。根据参考基因组,初步确定了控制开花期的关键候选基因Ntab0279610,该基因与拟南芥控制开花的关键基因SOC1高度同源,可能在控制烟草开花时间上起到关键作用。研究结果为进一步揭示烟草开花期遗传调控机制及育种改良奠定了基础。 | 孙滢 姜自鹏 刘洪泰 孙明铭 蒋彩虹 任民 刘旦 罗朝鹏 张剑锋 杨军 杨爱国 程立锐 | 2020 | 中国烟草科学2020，41，6： | 1 |
| 16 | 基于分子标记的园艺作物核心种质构建研究进展显示文摘分子标记能够在DNA水平上直接反映生物个体或种群间基因组中的某种特异性差异,且不受作物生长发育阶段及环境的影响,利用分子标记技术构建核心种质已成为作物种质资源领域研究的热点。概述了基于分子标记的果树、蔬菜、观赏植物等园艺作物核心种质构建研究进展、应用现状和存在的主要问题,探讨了今后园艺作物核心种质的发展方向,即加快园艺作物种质资源的基础数据、鉴定数据和评价数据的收集,采用多种数据相结合的分析方法,共同构建园艺作物核心种质,从而提高对园艺作物种质资源管理和利用水平。 | 吴茵 周坤华 方荣 袁欣捷 石博 陈学军 | 2016 | 辣椒杂志2016，，3： | 1 |
| 17 | 分子标记技术及其在玉米基因定位上的应用显示文摘分子标记作为一种新兴的遗传标记手段,因其特有的优势而得到广泛的应用,带动了许多领域的快速发展。相信随着分子生物学理论认识和技术手段的不断发展,分子标记技术会变得更高效更可靠,使其在各个领域发挥更大的作用。 | 吴迪 刘文霞 罗丹凤 周凯 王利枝 杨丽娟 孙婕 | 2012 | 农产品加工2012，，9： | 0 |
| 18 | 四倍体小麦胚大小性状QTL定位与分析显示文摘【目的】挖掘小麦胚大小性状相关的数量性状位点,解析胚大小与其他重要农艺性状之间的相关性,为胚相关性状QTL的精细定位及育种利用奠定基础。【方法】以四倍体小麦矮兰麦(Ailanmai)和野生二粒小麦(LM001)构建的121份F8代重组自交系群体(AM群体)作为研究材料,将其分别种植于成都市崇州试验基地(2018、2019和2020年)、成都市温江区试验基地(2020年)和雅安市试验基地(2020年),调查5个环境下的胚长、胚宽、胚长/胚宽、胚长/粒长、胚宽/粒宽以及胚面积6个性状,结合基于小麦55K SNP芯片构建的遗传连锁图谱对上述6个性状进行QTL定位。【结果】胚大小性状呈近似正态分布,符合数量性状的遗传特征。QTL定位共检测到27个胚大小相关性状的QTL,其中,7个分别控制胚长和胚宽的QTL可解释7.75%-21.74%和7.67%-33.29%的表型变异,共检测到5个在多环境稳定表达的主效QTL:QEL.sicau-AM-3B、QEW.sicau-AM-2B、QEW/KW.sicau-AM-2B、QEL/EW.sicau-AM-2B-1和QEA.sicau-AM-2B,其贡献率分别为11.88%-21.74%、21.77%-33.29%、8.80%-24.92%、12.79%-31.13%和10.47%-20.67%。另外,上述胚相关的位点形成4个QTL簇,分别为1B控制胚长/粒长和胚长的QTL簇,2B控制胚宽、胚长/胚宽、胚宽/粒宽以及胚面积的QTL簇,3B控制胚长和胚面积的QTL簇,6B控制胚长/胚宽、胚宽/粒宽的QTL簇。确定胚大小与小麦籽粒大小具有显著正相关性,且发现胚长主效位点QEL.sicau-AM-3B与粒长主效位点共定位,但胚宽主效位点QEW.sicau-AM-2B独立于粒宽主效位点存在。在主效QTL所在物理区间鉴定获得4个可能参与胚大小调控的基因。【结论】鉴定到5个控制胚相关性状的稳定表达的主效QTL:QEL.sicau-AM-3B、QEW.sicau-AM-2B、QEW/KW.sicau-AM-2B、QEL/EW.sicau-AM-2B-1和QEA.sicau-AM-2B,其中,QEW.sicau-AM-2B可能为新的QTL。 | 陈吉浩 周界光 曲翔汝 王素容 唐华苹 蒋云 唐力为 兰秀锦 魏育明 周景忠 马建 | 2023 | 中国农业科学2023，56，2： | 0 |
| 19 | 禾本科植物NBS研究进展显示文摘在本文中,主要介绍NBS型抗病基因的进展,NBS型抗病基因的共线性非常低。原因可能是NBS抗性基因之一在进化过程中导致基因丢失;NBS抗病基因进化太快,这可能导致植物病害抗性基因的很大程度的遗传差异,NBS疾病抗性基因作为一个很大的基因,也是近几年植物病害抗性基因和分子育种研究热点。 | 梁媛 兰冬雪 程吉云 吕玉光 李秀霞 张卫东 戚晓利 | 2017 | 农业与技术2017，37，24： | 0 |
| 20 | 馒头质构性状与单核苷酸多态性标记关联分析显示文摘质构是影响馒头品质的一个重要因素,研究馒头质构相关性状的基因位点对改良其品质具有指导意义。以205份小麦品种为实验材料,利用分布于小麦21条染色体的24 355个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记对其制成的馒头质构性状进行全基因组关联分析。共检测到与馒头质构性状显著关联的位点313个。其中,31个极显著(p<0.000 1)关联位点,11个位点至少在两个环境中表达,46个高遗传贡献率位点(R^2>10%),分布在小麦21条染色体中的15条。同时,还得到5个主效关联位点,如控制黏着性的极显著位点Kukri_c13329_800,在两个环境中表达且遗传贡献率>10%。得到的控制馒头质构相关性状的位点为在分子水平上研究馒头品质相关性状提供了一定参考。 | 刘娟 陈广凤 田纪春 吴澎 赵子彤 杨艺 李向阳 唐晓珍 | 2018 | 食品与发酵工业2018，44，7： | 0 |
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